Jak píše Jan Fiala, celý systém fitrace musí být trvale "pod vodou". Další řešení, mimo navrženého Janem Fialou, by bylo, před vstup do vlastního čerpadla fitrace, osadit běžnou levnou "ponorku", kterou by jsi vkládal do zdroje vody, s potřebou filtrování, spínanou současně s čerpadlem filtrace, která je schopná vodu nasát a systém vždy vodou zaplnit.
Ještě doplním. Pro výstup z té ponorky do čerpadla filtrace doporučuji použít plastové hadice od vysavačů. Pokud je seženeš někde ve sběrňáku. Dá se s nimi velmi dobře manipulovat a umožňují velký průtok vody.