Pokud má baterka 12,6V při chcípnutém motoru tak je to OK. Když to nastartuješ, tak by alternátor měl dávat okolo 14V (13,8V - 14,5V), pokud dává méně, je v pytli - nutná výměna.
Ještě je otázka, jestli to opravdu dělá dobíjení tj. "Točí lehce, chytit nechce". Pokud točí, ale nechytí, vada není v baterii ani v dobíjení, ale někde jinde, třeba uvolněné kabely atd.
Nová 55Ah baterie to nejspíše nevyřeší, ta 44Ah co tam máš teď je absolutně dostačující pro nastartování motoru, po nastartování by to vše měl táhnout alternátor + dobíjet baterii.
Takže vše proměřit - hlavně to dobíjení a pak se uvidí.