Na kolik tropických rostlin to má být, resp. kolik toho substrátu hodláte sterilizovat? V mikrovlnce se ten proces neprovádí v květináči, ale v sáčku - substrát je v něm uzavřený, takže se opravdu není třeba obávat toho, že byste "to nevyvětral".
Postup: http://www.cact.cz/noviny/2006/04/sterilizace.htm
V troubě by to jistě šlo taky, ale počítejte s tím, že potřebujete kromě trouby taky uzavřenou nádobu, substrát totiž nesmí přeschnout.