musí mít motor obsah nejvýše 50 ccm, jeho výkon nesmí překročit 1 kW a maximální konstrukční rychlost nesmí překračovat 25 km/h

Když to upravíš tak, aby max rychlost byla 40km/h, tak to asi logicky porušíš, co myslíš? Na to snad není nutné se tu ptát.

Kolo i motor samozřejmě homologaci mají a jsou schválené pro provoz

Ono to ale všechno musí být schválené dohromady. Když si koupím Felicii a dám do ní motor motor z Bugatti, tak to taky nebude schválené pro provoz. A to karoserie Felicie homologaci má a motor z Bugatti taky.

Jak na to hledí policie a má vůbec šanci zjistit, že se jedná o nestandart

Běžně to nikdo asi řešit nebude, museli by mít nějaké podezření (musel by tě někdo naprášit), nebo bys s tím musel udělat nějaký průser (aby "experti" kolo zkoumali a něco takového zjistili).